2060年，一颗巨大的陨石撞击在太平洋，造成的灾难令无数人死亡。
陨石带来的不仅是一系列的自然灾难，还有极度危险的外太空生物，外太空生物在地球的环境下不断繁衍壮大，直到有一天，巨大的外星怪兽从海洋中登录地面，对全球的人类开始了毁灭性的打击。
人类开始了漫长的反击战，一边全力建造地下城市供平民避难居住，一边在各种导弹以及重型武器效果甚微之后，为了保存人类火种，地球方面出动了核武器，怪兽通过海洋遍布全球，核武器打击全球之下，地球表面也变得不再适合生物生存。
在这场动乱之中，百分之八十的人类灭亡，幸存的平民们躲在世界各地的地下城中，战士们驻扎在地上的各个战斗基地，继续和后续敌人进行战斗，在此过程中人类的武器迅速进步，逐渐可以抵抗怪兽的袭击，地上分为沦陷区和交战区以及少部分安全区。
而地下城中生活的人民，想要到达地上需要十分繁琐的步骤，第一，要有防护服抵挡外界恶劣的环境，第二，要有飞行器，这样才能往来地上地下，第三，要有驾照（出入证明）。
许多平民为了生活，不断前往地上搜索战前遗留的各种物件换钱（信用点），因此衍生出许多相关职业，驾驶飞行器的拾荒者，维修飞行器的维修厂，以及贩卖各种地上物件的地下黑市。
主角江林（江流儿）从小生活在地下城中，是个孤儿，一直向往地上的世界，甚至还混在别的拾荒者队伍里溜出去过，他一直希望有驾驶资格，拥有自己的飞行器。
沈叶嘉（沙悟净）是一个精通机械修理的女机械师，在地下城开了一家飞行器修理场，江林经常到她这里参观，两人关系十分要好，欢喜冤家。
宋子安（孙悟空）是一个职业拾荒者，独来独往生人勿近，这次从地上归来，他将飞行器送到沈叶嘉这里来维修，随后前往黑市将外面找到的物件交给给黑市的一个商家老板朱文光（猪八戒），想要换取一些武器，并且看中了一把火力十足的珍贵枪械。
但朱文光认为宋子安找到的东西并不足够换取枪械，拒绝了对方的要求，宋子安趁对方不注意，偷走了枪械。朱文光反应过来之后，追赶宋子安。
另一方面，沈叶嘉的维修场中，沈叶嘉修理着宋子安的飞行器，江林对停放在这里的宋子安的飞行器十分感兴趣，在里面到处查看。
而匆忙逃窜回来的宋子安不顾沈叶嘉的劝阻开动了飞行器（飞行器能源还没有来得及补充），飞行器启动之际，在其中维修的沈叶嘉和参观的江林来不及逃脱，一行三人驾驶飞行器前往地上，而朱文光则开着自己的飞行器追赶。
两方人马慌慌张张在地上展开了追逐战，而地面的荒凉景象也让大家唏嘘不已。
虽然勉强暂时甩掉了朱文光，但宋子安的飞行器因为能源不够被迫降落在交战区边缘，被朱文光追上，四人对峙在一起。
这时，怪兽和军队的战斗波及到江林等人，几人开始了逃亡，江林也亲眼见证了怪兽的可怕，以及人类奋力反击的景象，内心无比震撼。
这一股军队虽然勉强击败了怪兽，但也是几乎全灭，军队之中的幸存者告诉江林等人，他们是为了探查怪兽大本营的敢死队，这么多年以来，怪兽无穷无尽的袭击人类，似乎没有尽头，科学家研究发现，这些怪兽之所以不断出现，是因为有一个类似虫后的怪兽统领存在，它可以不断繁殖，这才使怪兽难以灭绝，这么多年人类军队一直在努力探索怪兽虫后的所在，而这只小队成功找到了怪兽的老巢。
幸存者因为重伤过度死亡，拜托江林等人将怪兽的位置信息交给军事基地。几番思量之后，四人决定暂时放下争端。
朱文光的飞行器在刚才的战斗中被怪兽毁坏，宋子文将朱文光飞行器的能源用到自己的飞行器上，一行人带着怪兽老巢的位置信息前往军事基地。
顺利将怪兽的位置坐标交给军事基地长官，长官当即决定开始启动核武器打击怪兽虫后，江林一行人得到了暂时的休息。
核武器装填完毕，发射向虫后所在的位置，并且成功命中，但所有人都想不到的是，虫后不同于其他的怪兽，它自身具有一层生物防护罩，完全抵挡了核武器的攻击，并且在这次攻击下被激怒，从老巢移动出来，带着各种怪兽朝着军事基地进攻。
军队方面仓皇迎击，江林等人也被迫加入了战斗。虫后的防护罩让军队束手无策，被打得节节败退，宋子文等人的关系也在战斗中变得紧密起来。
军事基地派出所有的飞行器，江林等人也加入战斗，江林和沈叶嘉驾驶一艘飞行器，宋子文和朱文光驾驶一个。力图攻击虫后找寻漏洞，细心的江林发现，虫后每次展开防护罩时，脑后的脖颈都会发出红光，那里就是虫后的弱点所在，并且虫后的攻击和防御不能同时进行。
所有飞行器在江林的建议下展开行动，当务之急是困住虫后的前进脚步，阻止它靠近军事基地，为此江林一方开始不断击倒各种建筑物，压倒在虫后身上困住对方，而在虫后和其余怪兽的攻击下，军队损失惨重。
宋子文和朱文光驾驶的飞行器以及一些军队人员在前吸引虫后注意，不断攻击虫后，虫后不断张开收回防御罩发起进攻，宋子文和朱文光为了不让怪兽有所缓冲，全力吸引怪兽，在这期间被怪兽击中。
江林和沈叶嘉趁机对虫后的脖颈发起了袭击，并且成功重创，虫后在无法发起防御，军队长官再次启动核弹，一击击中了虫后的脑袋，虫后被消灭。
此后，地球上其余的怪兽在军队的不断进攻下被消灭殆尽，并经过长时间的环境净化，人类重新回归了地上世界。
而江林等人的故事被绘画成漫画以及电影，供后世传扬瞻仰。
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